W 1988 roku, z okazji dziesiątej rocznicy pontyfikatu Papieża – Polaka, rozpoczęto w Kałkowie budowę Domu Jana Pawła II. Ukończono go w 1991 roku. Trzypiętrowy budynek od razu zaczął pełnić ważną rolę w Sanktuarium.
Parter zajmuje ogromna Aula, z pięknymi kasetonami u sufitu. W niej znajduje się kopia obrazu „Polonia” Antoniego Tańskiego. Jest tu również cykl obrazów, przedstawiających życie Sługi Bożego Kardynała Stefana Wyszyńskiego.
W auli odbywają się konferencje, zjazdy, spotkania większych grup. Sala służy również do wystawiania przedstawień religijno – patriotycznych, misteriów Męki Pańskiej w Wielkim Poście, jasełek w okresie Świąt Bożego Narodzenia, wystaw religijno-historyczno-patriotycznych.
Na piętrach znajdują się pokoje dla pielgrzymów. Niejako przedłużeniem Domu Jana Pawła II jest Herbaciarnia, parterowy budynek służący pielgrzymom za stołówkę i miejsce odpoczynku.